Seminario de la División de Ingeniería
Título: Evolución de Tolerancia a Fallas en Redes Genéticas.
Presenta: Dr. Thomas MacCarthy

Los sistemas biológicos están caracterizados por paradigmas de cómputo muy distintos a los de sistemas típicos de ingeniería. Entender mejor los sistemas biológicos nos puede llevar a métodos computacionales completamente novedosos. Durante el proceso de desarrollo de un feto, genes llamados factores de transcripción interactúan entre si para definir los distintos tipos de células del cuerpo. Las interacciones entre los genes forman redes de activación e inhibición llamadas redes genéticas. Estos sistemas tienden a ser robustos a perturbaciones tanto genéticas (por ejemplo, fallas de algunos genes) y ambientales (por ejemplo, cambios de temperatura). Entendemos poco sobre los mecanismos que causan esta tolerancia a fallas y para investigarlos usamos modelos computacionales. De esta manera hemos encontrado que las redes genéticas existen dentro de conjuntos enormes de redes “funcionalmente equivalentes” que satisfacen tareas particulares, una característica que comparten con otros sistemas biológicos tan distintos como redes de reacciones metabólicas y de plegado de RNA. La evidencia sugiere que la flexibilidad de las interacciones genéticas es un factor crítico en la evolución de robustez en redes genéticas.

Thomas MacCarthy es egresado del ITAM (Ingenería en Computación, 1995). Después de hacer una maestría en redes neuronales en King’s College London (1996), hizo una transición hacia biología al hacer su doctorado sobre modelos de evolución en redes genéticas de determinación de sexo en University College London, donde terminó en 2005. A partir de entonces ha trabajado como investigador posdoctoral en el Albert Einstein College of Medicine en Nueva York. A partir de enero 2012 empieza su propio laboratorio de investigación en biología computacional en SUNY Stony Brook, cerca de Nueva York.

Afiliación: Albert Einstein College of Medicine y SUNY Stony Brook, Nueva York.